História Múzea Jána Thaina sa začala písať v roku 1936 pod názvom Mestské múzeum. Zakladateľmi boli Béla Szőke, prof. Ján Thain, kpt. Ludvík Albrecht a Kazimír Saskó. V tom čase tu mala svoju premiéru výstava s tureckou tematikou, ktorá bola prezentovaná pri príležitosti 250. výročia oslobodenia Nových Zámkov spod osmanskej nadvlády.

V súčasnej dobe sa múzeum venuje najmä výskumu a dokumentácii novozámockého regiónu. Návštevníkom ponúka hneď niekoľko stálych expozícii:

• „Po stopách predkov“ – archeologická expozícia približujúca medzníky kultúrneho, spoločenského a dejinného vývinu ľudskej spoločnosti v regióne od staršieho paleolitu až po 16. storočie.

• „Odviate časom“ - historická expozícia venujúca sa dejinám Nových Zámkov od obdobia stredoveku až do polovice 20. storočia.

• „Z klenotnice ľudového umenia“ a „Zo života predkov“ - národopisná expozícia obsahujúca reprezentatívny výber z najkrajších zdobených predmetov etnografickej zbierky múzea. Expozícia tiež ponúka pohľad na život našich predkov z 1. polovice 20. storočia.

• Anton Bernolák (život a dielo) - zachytáva búrlivé obdobie na konci 18. storočia zhmotnené v osobe Antona Bernoláka.

• Czuczor Gergely (život a dielo) – expozícia prezentuje život významného spisovateľa a básnika, ktorý prispel k rozvoju maďarského národné eposu, balád ako aj jazykovedy.

Múzeum Jána Thaina spravuje aj ďalšie dve vysunuté expozície - Archeologické múzeum vo Svodíne a Dom ľudových tradícií vo Svodíne.